La meditazione dzogchen implica accedere al rigpa, la nostra consapevolezza pura, realizzando che è completa di tutte le buone qualità. Il rigpa corrisponde all'attività mentale di chiara luce che conosce la sua stessa natura di due verità. Sebbene la continuità del rigpa basilare individuale di ciascun essere è priva di contaminazioni, senza inizio né fine, c'è anche un fattore senza inizio, chiamato "confusione" che automaticamente sorge simultaneamente con ciascuno momento della cognizione. Tale fattore offusca l'innata buona qualità del rigpa di avere una profonda consapevolezza riflessiva della sua stessa natura formata da due verità. Quando il rigpa basilare scorre insieme a questo fattore temporaneo di confusione, il rigpa basilare funziona come un alaya per le abitudini di afferrarsi ad un'esistenza veramente stabilita. Lo scopo della meditazione dzogchen è di ottenere un vero arresto dell'alaya per le abitudini e il funzionamento completo di tutte le innate buone qualità del rigpa per essere di massimo beneficio per tutti gli esseri.